在掌握養分平衡的情況下，還要注意水溶性有機質的配合使用，包括使用二氧化碳氣肥。 避免直接沖施，要采取二次稀釋。水溶肥比一般復合肥養分含量高，用量相對較少，直接沖施極易造成燒苗傷根、苗小苗弱等現象，二次稀釋不僅利于肥料施用均勻，還可以提高肥料利用率。
生物菌肥應注意的事項 1、施用時期：生物菌肥不是速效肥，一般作底肥，如果追施，在作物的營養臨界期和營養大量吸收期前7-10天施用，效果好。 2、混合：應注意，不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥(如硫酸鉀等)以及草木灰混合用，因為這些藥、肥，很容易殺死生物菌。或者先施菌肥，隔48小時后，再打藥除草。若拌種，切忌和已拌好殺菌劑的種子混合使用。還應防止與未腐熟的農家肥混肥。
生物菌肥料的優點： (1)通過有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物的根系周圍形成了優勢種群，抑制了其他有害菌的生命活動。 (2)快速分解土壤有機物質，促進土壤團粒的形成，且通過有益菌的活動能夠疏松土壤，土壤的保肥、供肥、保水、供水及透氣性都得到很好的調節。 (3)分解土壤中的農藥殘留，避免殘留農藥對下季作物產生藥害。還對植物生長過程通過根系排放的有害物質進行分解。
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