有機肥料含有植物所需要的許多營養成分、微量元素、糖類和脂肪。有機肥分化開釋的CO2可作為物光合效果的材料。有機肥還含有氮、磷、鉀5%三要素，有機質45%，可為農作物供給的營養。不得不提的是有機肥在土壤中分化，能夠轉化形成各種的腐殖酸是一種高分子物質，具有很好的絡合吸附功能，對重金屬離子有很好的絡合吸附效果，能有效地減少重金屬離子對作物的毒害，并阻撓其進入植株中，并且維護植腐殖酸物質物的根莖。
化肥的實踐運用率只要30%～45%。丟失的化肥一部分分化開釋到大氣中，一部分則隨著水土流失掉了，還有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收運用。當施入有機肥后，因為有利生物活動改進了土壤結構，添加了土壤保水保肥才能，從而削減了營養的流失。加上有利微生物解磷解鉀效果，能使化肥有效運用率進步到50%以上。
糞肥中含有豐富的有機質和作物所需要的各種營養元素，對增加作物產量和提高土壤肥力具有良好的作用，一直以來都被廣泛應用于農業生產中。古時候就流傳著“糞多則肥多，肥多則田沃，田沃則谷多”的說法。近年來，隨著糞肥不合理的施用現象增多，各種問題也隨之而來。
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