有機肥料的顆粒不會是圓滑的，由于原料因素，有機肥的造粒很難達到規則。目前，市場上泛起有一種顆粒有機肥，造粒比較光滑，甚至比復合肥或是尿素的顆粒都要光滑良多，這類有機肥是產業廢渣制作，營養成分比以動植物為原料出產的有機肥低良多。
化肥的實踐運用率只要30%～45%。丟失的化肥一部分分化開釋到大氣中，一部分則隨著水土流失掉了，還有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收運用。當施入有機肥后，因為有利生物活動改進了土壤結構，添加了土壤保水保肥才能，從而削減了營養的流失。加上有利微生物解磷解鉀效果，能使化肥有效運用率進步到50%以上。
糞肥中含有豐富的有機質和作物所需要的各種營養元素，對增加作物產量和提高土壤肥力具有良好的作用，一直以來都被廣泛應用于農業生產中。古時候就流傳著“糞多則肥多，肥多則田沃，田沃則谷多”的說法。近年來，隨著糞肥不合理的施用現象增多，各種問題也隨之而來。
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