生態有機肥具有完整的營養元素，可以改善土壤板結，改善化肥使用造成的土壤板結。改善土壤理化性質，增強土壤保水、保肥、供肥能力。 生物有機肥中的有益微生物進入土壤后，與土壤中的微生物形成共生增殖關系，抑制有害細菌的生長，轉化為有益細菌，相互作用，相互促進，起到群體協同作用。有益細菌在生長繁殖過程中產生大量代謝產物，促進有機物的分解和轉化，可以直接或間接為作物提供各種營養和刺激性物質，促進和控制作物的生長。
有機肥料的主要功能 有機肥料的主要作用是增加土壤中的有機質，以激活土壤。當土壤中的有機質增加時，可以形成土壤的顆粒狀結構。當土壤正常時，作物的根系可以生長良好，作物更有可能吸收養分，這有利于提高作物產量。 因此，在我們區分有機肥和復合肥的作用后，我們會明白有機肥不是為了增加營養，而是為了調節土壤，因此沒有必要注意有機肥中有多少營養元素。
生物有機肥的應用更加靈活。生物有機肥中氮、磷、鉀含量相對較低，一般在5%左右，養分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有機肥可以作為基肥.種肥.追肥施用不會產生任何不利后果。 因此，雖然生物有機肥是一種新型的有機肥，但其應用與傳統的有機肥施用差別不大。只要我們注意到這些點，就會有一定的應用效果。
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