生態有機肥具有完整的營養元素，可以改善土壤板結，改善化肥使用造成的土壤板結。改善土壤理化性質，增強土壤保水、保肥、供肥能力。 生物有機肥中的有益微生物進入土壤后，與土壤中的微生物形成共生增殖關系，抑制有害細菌的生長，轉化為有益細菌，相互作用，相互促進，起到群體協同作用。有益細菌在生長繁殖過程中產生大量代謝產物，促進有機物的分解和轉化，可以直接或間接為作物提供各種營養和刺激性物質，促進和控制作物的生長。
有機肥料的作用 1、促進根系壯苗。養根、護根、生根，促進光合作用，保花保果。 2、改良土壤。激活土壤，快速改善土壤板結和次生鹽極化。長期使用可以改善土壤有機質，改善土壤顆粒結構，促進土壤微生物繁殖，使土壤疏松通風，易于排水耕作。提高保水、保肥、供肥能力。
生物有機肥的應用更加靈活。生物有機肥中氮、磷、鉀含量相對較低，一般在5%左右，養分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有機肥可以作為基肥.種肥.追肥施用不會產生任何不利后果。 因此，雖然生物有機肥是一種新型的有機肥，但其應用與傳統的有機肥施用差別不大。只要我們注意到這些點，就會有一定的應用效果。
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