在清淤環節要積極采用環保清淤方式,在環保、成本方面進行綜合考慮,把多種清淤方式相結合。水力沖淤使得淤泥中的污染物擴散,所以要盡量的避免或者當河淤泥污染較輕的時候采用。機械清淤中的挖泥船挖泥清淤不但沒有把淤泥中污染負荷的浮泥去除,反倒在清淤中攪動原本已沉積下來的污染物,使得污染擴散，所以要根據實際在淤泥污染負荷較低的河道采用。 人工沖淤也應要充分的考慮河道結構的現狀及排泥條件。要大力推廣生態清淤，河道清淤公司在底泥污染負荷很大的時候，先進行生態清淤降低污染負荷使至安全范圍，然后進行水力的清淤或者機械式的清淤。

池塘由于水產養殖動物的排泄物、遺體、殘餌和施肥的不斷積累，以及地表沖積物等不斷沉積，沉積有機物經微生物發酵分解，形成大量腐植質，與池底表面浸潤土壤混合在一起，在池底形成一定厚度的淤泥。淤泥過會造成危害： 導致池水缺氧危害養殖動物 淤泥中含有大量的有機物，有機物經細菌作用，氧化分解，消耗大量氧，往往使池塘下層水中本來不多的氧消耗殆盡，造成缺氧狀態。養殖魚類在溶氧3毫克/升以下時，就會抑制魚的生長，溶氧低于1.5毫克/升時，就會造成養殖魚類的泛塘死亡。

河道淤泥處理的化學固化技術因其較低的處置成本低，且處置過程無污染、資源化利用效率高、固化體穩定性好等優點，成為我國大力支持的河道淤泥處置技術。然而，由于河道淤泥含水率和有機質含量均較高，嚴重影響了固化效果和固化體的強度，開發高效綠色的新型固化材料，成為支撐河道淤泥無害化利用的關鍵。