水下清淤是應該注意海流有一定的流向和流速，有的海域還多層流，在這種情況下，海流在不同的深度，有其各自的流向和流速，而且流向和流速隨時間的變化而變化。在江、河中，同樣也存在著水的流動。 水下清淤須派有經驗的潛水員下潛，同時水面應安排有經驗的潛水員擔任應急救護潛水員。 水下清淤潛水員下潛和上升時必須緊握入水繩，必要時應使用鉤。在水底時不得離開行動繩。盡量采用水面減壓法，減壓方案應選用延長方案。

水下清淤時需要開啟底孔閘門發生的沖刷，這種沖刷只是在底孔前形成一個范圍有限的沖刷漏斗。漏斗發展完畢后，沖刷也就終止漏斗發展的大小又與淤積物固結程度有關。末充分固結的新淤積物，易于沖刷，沖刷漏斗就較大。 工程機械作業，挖除淤積泥沙，保持有效庫容或進水口不被阻塞，整機為干式下泵型，電機采用油室密封方式，水庫大壩水下清淤內設有機械密封，能有效防止高壓水和雜質進入電機內腔，除主葉輪外，還有攪拌葉輪，能將沉淀于水底的淤渣攪拌成湍流后抽取出來。葉輪和攪拌葉輪等過流部件采用高硬度的高鉻鑄鋼制造，耐磨、耐腐蝕、排污能力比較強，能通過較大的固體顆粒。

河道淤泥處理的化學固化技術因其較低的處置成本低，且處置過程無污染、資源化利用效率高、固化體穩定性好等優點，成為我國大力支持的河道淤泥處置技術。然而，由于河道淤泥含水率和有機質含量均較高，嚴重影響了固化效果和固化體的強度，開發高效綠色的新型固化材料，成為支撐河道淤泥無害化利用的關鍵。