合理選擇各種設備和裝置，力求實現人流和物流的順暢和短流程，合理選擇氣流流型樣本，合理配置凈化空調系統，合理采用各種有特殊要求的技術措施，合理布置潔凈廠房的平面和空間，實現可靠、經濟的運行。GMP車間凈化設計應保證安全生產并符合環保要求。GMP車間凈化的安裝和各種設施的設計必須滿足消防和防火的要求，并應按有關標準和規范進行設計。由于GMP車間凈化中獨特的布局和空間以及曲折的走道，在系統設計、設備配置和各種技術設施的材料樣品選擇中，應特別注意選擇符合要求的系統、設施和材料。

如果不能遠離嚴重的大氣污染源，應位于其高頻風向的上風側，或其低頻風向全年的下風側。車間凈化工程配套設施的要求。凈化車間的一些配套設施也分為凈化通道、管理用房、設備用房、電源用房、物料交換用房等幾個區域。配套的設備也需要一定的人員來操作，尤其是一些主要設備需要定期的檢查和維護，這樣凈化效果才能保持非常高的標準運行。車間凈化工程的建設要求主要集中在凈化工程材料的選擇、車間凈化工程環境、車間凈化工程配套設施的準確要求。

密封條設置在門經常開關的情況下，除了有些外門全部設置在門扇上，以避免重型設備和其他運輸的碰撞，或者有些內門由于車間運輸不允許在地面設置門檻，只能在靠近地面的門扇底部安裝懸掛式清掃密封條。一般為了盡可能避免密封條接觸、踩腳或被車撞，少受人和運輸的影響，在上面鋪設長寬只有幾毫米的小截面形狀的彈性密封條。密封條應沿著活動縫隙的四周連續鋪設，以便在車門關閉后形成一條封閉的環形密封線。門樓和門扇分別設置密封條時，要注意兩者之間的良好連接，盡量減少密封條在門縫處的中斷縫隙。