在PCR實驗室凈化中，需要保證運行區域內速度場的均勻性。這種一致性有兩個主要原因:通風柜排氣口位置不符合工藝特點，如熱期下排氣口，冷期上排氣口。通風柜布局不當，比如經常打開的門窗附近的通風柜。一種情況，因為化學實驗室的工藝通常是不確定的，所以在PCR實驗室凈化中推薦使用同時吸入的通風柜。在第二種情況下，應與土建密切配合，以滿足通風的需要。通風柜操作口的入口風速也是設置通風柜排風系統的重要參數，與工藝和類型密切相關。

實驗室凈化工程之所以干凈，首先是通過一種特殊的工藝阻斷空氣與使用空間的自由交流，然后通過人工的手段將空氣輸送到使用空間。當然，新鮮空氣和渾濁空氣都要運到這里。所謂濁氣，就是將使用空間內的空氣輸送到外界并經過處理使之成為潔凈空氣，再輸送回使用空間。原理可以用下面的流程圖簡單說明:氣流_一次空氣處理_空調_+中間空氣處理_+風機送風_凈化管道_高效送風口-潔凈室-除塵-回風風道-新風和一次空氣處理。

實驗室凈化工程不僅起到保護實驗樣品安全的作用，也是保證實驗成功和實驗人員安全的重要措施之一。實驗室凈化工程是將實驗室的某一區域開辟出來，專門用于建造空氣潔凈，對實驗環境要求相對較高的實驗室或無菌室。實驗室凈化工程系統其實和傳統的潔凈室系統差不多，只是潔凈室的壓力、微生物控制、溫濕度控制比工業潔凈室更嚴格。常見的實驗室凈化工程裝修材料有夾層彩鋼板、鋼化玻璃、防火板等。潔凈實驗室必須按照潔凈室施工及驗收標準，采用密封性好、不產生粉塵的材料進行隔斷和吊頂裝修。潔凈實驗室的通風系統一般采用組合式空調機組。