土壤中的有機(jī)質(zhì)能顯著改進(jìn)土壤的理化性狀，使土壤耕性變好，滲水才能增強(qiáng)，進(jìn)步土壤蓄水、保肥、供肥和抗旱防澇才能，增產(chǎn)明顯，這是化肥不能代替的。添加土壤有機(jī)質(zhì)的方法主要是增施有機(jī)肥，包括人畜糞尿、土雜肥、秸稈、商品有機(jī)肥等。

有機(jī)肥含有維生素、抗生素等，可增強(qiáng)農(nóng)作物抗性， 或防止病害發(fā)生。有機(jī)肥施入土壤后，可增強(qiáng)土壤的蓄水保水才能，在干旱情況下，能增強(qiáng)作物的抗旱才能。有機(jī)肥還可使土壤變得疏松，改進(jìn)作物根系的生態(tài)環(huán)境，促進(jìn)根系的成長，增強(qiáng)根系活力，進(jìn)步作物耐澇才能，削減植物的逝世率，進(jìn)步了農(nóng)產(chǎn)品的生存率。

糞肥中含有豐富的有機(jī)質(zhì)和作物所需要的各種營養(yǎng)元素，對增加作物產(chǎn)量和提高土壤肥力具有良好的作用，一直以來都被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中。古時(shí)候就流傳著“糞多則肥多，肥多則田沃，田沃則谷多”的說法。近年來，隨著糞肥不合理的施用現(xiàn)象增多，各種問題也隨之而來。