有機肥可以提高土壤孔隙度、通透性和植物存活率，增加有益菌、土壤微生物和種群。同時，作物根系形成的優勢有益菌群可以抑制有害病原菌的繁殖，增強作物的抗逆性和抗病能力，降低重茬作物的病情指數。連續幾年的應用可以大大緩解連作障礙。減少環境污染是一種環保肥料，對人、動物、環境安全無毒。

有機肥料的主要功能 有機肥料的主要作用是增加土壤中的有機質，以激活土壤。當土壤中的有機質增加時，可以形成土壤的顆粒狀結構。當土壤正常時，作物的根系可以生長良好，作物更有可能吸收養分，這有利于提高作物產量。 因此，在我們區分有機肥和復合肥的作用后，我們會明白有機肥不是為了增加營養，而是為了調節土壤，因此沒有必要注意有機肥中有多少營養元素。

生物有機肥的應用更加靈活。生物有機肥中氮、磷、鉀含量相對較低，一般在5%左右，養分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有機肥可以作為基肥.種肥.追肥施用不會產生任何不利后果。 因此，雖然生物有機肥是一種新型的有機肥，但其應用與傳統的有機肥施用差別不大。只要我們注意到這些點，就會有一定的應用效果。