有機肥可以提高土壤孔隙度、通透性和植物存活率，增加有益菌、土壤微生物和種群。同時，作物根系形成的優勢有益菌群可以抑制有害病原菌的繁殖，增強作物的抗逆性和抗病能力，降低重茬作物的病情指數。連續幾年的應用可以大大緩解連作障礙。減少環境污染是一種環保肥料，對人、動物、環境安全無毒。

有機肥的主要目的是改善土壤中的有機質，其中有機質含量相對較高，營養元素相對較少。 有機肥的組成 有機肥主要用于動物糞便，植物秸稈.以工業廢料為原料，腐爛后制成。在此期間，添加一些腐植酸，主要是有機質。有機肥與復合肥的主要區別在于，有機肥主要是有機質，而復合肥主要是微量元素為主，其功能和效果完全不同，但可以相互補充。 有機肥機質是有機肥中的主要有機質，也有一些微量元素，其中微量元素可以忽略，大量元素約占4%，幾乎可以忽略不計。具體來說，也是氮.鉀元素相對較多。

生物有機肥的應用更加靈活。生物有機肥中氮、磷、鉀含量相對較低，一般在5%左右，養分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有機肥可以作為基肥.種肥.追肥施用不會產生任何不利后果。 因此，雖然生物有機肥是一種新型的有機肥，但其應用與傳統的有機肥施用差別不大。只要我們注意到這些點，就會有一定的應用效果。