發酵豬糞是生活中常見的農業廢棄物，很多農民朋友都使用豬糞做有機肥。但是經過發酵的豬糞施給作物的話，因為發酵不徹底，會發生“二次發酵”的現象，當發酵條件具備時，在微生物的活動下，生糞發酵：當發酵部位距根較近或作物植株較小時，發酵產生的熱量會影響作物生長，引起“燒根、燒苗”，嚴重時會導致植株死亡。而且生豬糞中的細菌比較多，很容易造成作物的病蟲害。

豬糞發酵成有機肥可以用生物發酵方法，需要的原料有豬糞、發酵劑、玉米面、秸稈等。將需要腐熟的豬糞倒入田間攤開，然后加上適量的花生秸稈。加上秸稈能調節有機肥中的碳氮比，提高透氣性。 在發酵時，加入生物菌劑，它的作用是為了促進發酵，能快速腐熟。不同的發酵劑的用量也不同，農戶可按照要求的用量使用。生物菌劑和玉米面混合均勻，玉米面的作用是提供微生物活動的載體，有利于微生物的繁殖，加快發酵速度。

豬糞和秸稈混合之后，將混合好的生物菌和玉米面撒到上面，然后澆水，豬糞較干時，可以增加水的用量，豬糞含水量大時，就可以少用水，最后堆悶漚制成有機肥，堆漚的面積和長度不受限制。經過發酵兩三天之后，再進行翻一遍。 豬糞發酵時，加上有機肥發酵劑，能節省發酵時間，大概7~10天的時間就能發酵好，適合大量的豬糞處理，發酵速度快，而且還能防止豬糞腐熟不徹底。